| надцарство | Клеточные (Cellularia) |
| надцарство | Эукариоты (ядерные) (Eukaryota, Nuclearia) |
| царство (regnum) | Животные (Animalia, Zoa) |
| подцарство (subregnum) | Многоклеточные (Mеtazoa) |
| тип (phylum) | Хордовые (Chordata) |
| подтип (subphylum) | Позвоночные (черепные) (Vertebrata) |
| класс (classis) | Млекопитающие (Mammalia) |
| подкласс (subclassis) | Высшие звери (плацентарные) (Eutheria, Рlacentalia) |
| отряд (ordo) | Парнокопытные (Artiodactyla) |
| подотряд (subordo) | Нежвачные (Njnruminantia) |
Содержит два рода, в которых имеется по одному виду: бегемот обыкновенный и бегемот карликовый. Представители семейства бегемотовых встречаются только в Африке.
Результатами раскопок существование бегемотовых доказано уже с периода миоцена. Вплоть до плейстоцена они были распространены также в Европе и Азии. Новейшие генетические исследования намекают на то, что бегемотовые — близкие родственники китов, то есть были их сухопутными родоначальниками.